Comme l'iPad 2, l'Eee Pad Transformer Prime possède un système d'aimants qui permet d'accrocher une protection d'écran. Asus n'a pas manqué de proposer sa propre Smart Cover.
Si elle reprend le nom, l'apparence générale et même certains détails de la Smart Cover d'Apple, la version d'Asus ne se contente pas de se plier en triangle. Elle possède une structure « origami » qui permet de la plier de trois différentes façons.